PDB文件阅读器是一种用于查看和解析蛋白质数据库（Protein Data Bank）文件的工具，主要面向生物化学、结构生物学等领域的研究人员。它能够读取PDB格式文件（包含蛋白质、核酸等生物大分子的三维结构数据），并以可视化形式展示分子模型，支持旋转、缩放、标注原子或残基等操作。部分高级阅读器还提供氢键分析、静电势计算、二级结构标注等功能。常见的PDB阅读器包括PyMOL、ChimeraX、VMD等开源软件，它们通过图形界面或命令行帮助用户直观理解分子构象、相互作用及动态变化，为药物设计、分子对接等研究提供基础支持。